UIN Imam Bonjol Padang, sebagai salah satu lembaga pendidikan tinggi agama islam di Sumatera Barat memiliki visi Menjadi Universitas Islam Yang Kompetitif di Asean tahun 2037. Salah satu cara untuk mencapai visi tersebut yaitu harus didukung oleh pengelola perguruan tinggi yang kompeten di bidangnya.

Adapun nama pimpinan UIN Imam Bonjol sebagai berikut:

  1. Rektor: Prof. Dr. Martin Kustati, M.Pd
  2. Biro Administrasi Umum, Perencanaan dan Keuangan: Dra. Hj. Kafrina, M.Si
  3. Biro Administrasi Akademik Kemahasiswaan dan Kerjasama: H. Hendri, S.Ag, M.Pd
  4. Wakil Rektor I Bidang Akademik dan Kelembagaan: Dr. Yasrul Huda, MA
  5. Wakil Rektor II Bidang Administrasi Umum, Perencanaan dan Keuangan: Dr. Testru Hendra, M.Ag
  6. Wakil Rektor III Bidang Kemahasiswaan dan Kerjasama: Welhendri, S.Ag, M.Si, Ph.D
  7. Dekan Fakultas Dakwah dan Ilmu Komunikasi: Dr. Wakidul Kohar, M.Ag
  8. Dekan Fakultas Tarbiyah dan Keguruan: Dr. Yasmadi, M.Ag.
  9. Dekan Fakultas Syariah: Dr. H. Ikhwan, SH, M.Ag
  10. Dekan Fakultas Ushuluddin: Dr. Andri Ashadi, M.Ag
  11. Dekan Fakultas Adab dan Humaniora: Nelmawarni, S.Ag, M.Hum., Ph.D,
  12. Dekan Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam: Ahmad Wira, M.Si, M.Ag., Ph.D,
  13. Dekan Fakultas Sains dan Teknologi: Nurus Shalihin, M.Si., Ph.D.
  14. Direktur Pascasarjana: Prof. Dr. Firdaus, M.Ag
  15. Ketua Lembaga Penjamin Mutu: Dr. Zulhedi, M. Ag
  16. Ketua Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat: Hulwati, M.Hum., Ph.D.